Določanje genotipa PIK3CA
Uvod. Somatske mutacije v genu PIK3CA najdemo pri številnih vrstah raka (tabela 1). Mutacije v genu PIK3CA so specifične glede na vrsto, včasih tudi podvrsto, raka. Najpogostejša mesta mutacij oziroma t.i. “hot spots” sta kodona 542 in 545 v eksonu 9 ter kodon 1047 v eksonu 20.
Tabela 1: Vrste raka z mutacijami v genu PIK3CA.
| Vrsta rakavega obolenja | % tumorjev z mutacijami |
| rak dojke | 20-40 |
| rak debelega črevesa | 20-30 |
| rak endometrija | 36 |
| rak glave in vratu (ploščatocelični) | 33 |
| rak želodca | 25 |
| možganski tumorji | 10-20% |
| rak danke | 8 |
| rak ovarijev | 5-10 |
| rak trebušne slinavke | 11 |
| rak ustne votline (ploščatocelični) | 7 |
| rak pljuč | 4 |
Mutacijski status gena PIK3CA uporabljamo kot napovedni dejavnik za odzivnost bolnika na zdravljenje. Mutacije v genu PIK3CA po eni strain lahko poslabšajo odzivnost na zdravljenje s številnimi kemoterapevtiki in nekaterimi biološkimi zdravili, ali nasprotno, izboljšajo odzivnost na zdravljenje z zaviralci PI3K/AKT/mTOR signalne poti.
Mutacijski status gena PIK3CA lahko uporabimo tudi kot prognostični dejavnik (oz. pokazatelj obnašanja tumorja).
Vrsta vzorca. Tumorsko tkivo vklopljeno v parafin (FFPE); možno tudi sveže ali zamrznjeno tumorsko tkivo.
Metoda. Za testiranje prisotnosti mutacij v genu PIK3CA uporabljamo kvantitativni PCR in/ali sekvenciranje. Določamo najpogostejše mutacije v eksonih 9 in 20.
Čas potreben za preiskavo. 2 tedna od prejema vzorca
Reference:
- Ligresti G, Militello L, Steelman LS, Cavallaro A, Basile F, Nicoletti F, Stivala F, McCubrey JA, Libra M. PIK3CA mutations in human solid tumors: role in sensitivity to various therapeutic approaches. Cell Cycle. 2009; 8 (9): 1352-8.
- Campbell IG, Russell SE, Choong DY, Montgomery KG, Ciavarella ML, Hooi CS, Cristiano BE, Pearson RB, Phillips WA. Mutation of the PIK3CA gene in ovarian and breast cancer. Cancer Res. 2004; 64 (21): 7678-81.
- Levine DA, Bogomolniy F, Yee CJ, Lash A, Barakat RR, Borgen PI, Boyd J. Frequent mutation of the PIK3CA gene in ovarian and breast cancers. Clin Cancer Res. 2005; 11 (8): 2875-8.
- Samuels Y, Wang Z, Bardelli A, Silliman N, Ptak J, Szabo S, Yan H, Gazdar A, Powell SM, Riggins GJ, Willson JK, Markowitz S, Kinzler KW, Vogelstein B, Velculescu VE. High frequency of mutations of the PIK3CA gene in human cancers. Science. 2004; 304 (5670): 554.
- DeRoock W, Claes B, Bernasconi D, et al. Effects of KRAS, BRAF, NRAS, and PIK3CA mutations of the efficacy of cetuximab plus chemotherapy in chemotherapy-refractory metastatic colorectal cancer: A retrospective consortium analysis. Lancet Oncol. 2010; 11: 753-762.
- Janku F, Wheler JJ, Westin SN, Moulder SL, Naing A, Tsimberidou AM, Fu S, Falchook GS, Hong DS, Garrido-Laguna I, Luthra R, Lee JJ, Lu KH, Kurzrock R. PI3K/AKT/mTOR inhibitors in patients with breast and gynecologic malignancies harboring PIK3CA mutations. J Clin Oncol. 2012; 30 (8): 777-82.