Spremljevalna dokumentacija:

Vzorci napoteni za molekularno-biološko preiskavo morajo biti ustrezno označeni in opremljeni z ustrezno dokumentacijo:

• naročniki znotraj OIL –napotnica za molekularno-biološko preiskavo 
• zunanji naročniki - napotnica za molekularno-biološko preiskavo, kateri je obvezno treba priložiti delovni nalog ali zeleno napotnico ali elektronsko napotnico.

Vrsta vzorcev in odvzem:

NAVODILA ZA ODVZEM VZORCEV KRVI ZA MOLEKULARNO GENETSKE PREISKAVE:

• OBR-1165-1070-MD-STO Navodila za odvzem vzorcev krvi za molekularno genetske preiskave

NAVODILA ZA PRIPRAVO VZORCEV TKIVA V EPICO ZA MOLEKULARNO GENETSKE PREISKAVE:

Tumorsko tkivo:

• OBR-851-1070-MD-STO Navodila za pripravo vzorcev tkiva za izolacijo DNA/RNA v epico iz tumorskega tkiva.pdf

Netumorsko tkivo:

• OBR-854-1070-MD-STO Navodila za pripravo vzorcev tkiva za izolacijo DNA/RNA v epico iz netumorskega tkiva

Izjemoma priprava na stekelcih:

• OBR-853-1070-MD-STO Navodilo za pripravo vzorcev FFPE na stekelcih za genotipizacijo iz tumorskega tkiva.pdf

Za molekularno-genetsko določanje mikrosatelitske nestabilnosti (MSI) potrebujemo za vsakega bolnika 5-10 rezin tumorskega in ločeno še 5-10 rezin netumorskega tkiva. V primeru, da netumorsko tkivo ni na voljo, zagotovite vzorec krvi (odvzem v epruveto z EDTA).

Določanje MSI naročite z napotnico OBR-849-1070-MD-STO NAPOTNICA ZA MOLEKULARNO GENETSKO PREISKAVO - GENOTIPIZACIJA SOMASTKIH MUTACIJ IZ TUMORSKEGA TKIVA.pdf.

NAVODILO ZA SHRANJEVANJE IN PRIPRAVO CITOLOŠKIH VZORCEV ZA IZOLACIJO RNA

OBR-1018-1070-MD-STO Navodilo za shranjevanje in pripravo citolških vzorcev za izolacijo RNA

Označevanje vzorcev

• Sveže odvzeti vzorci (kri, kostni mozeg, aspiracijska biopsija in eksudat):
  • ime in priimek bolnika, datum rojstva bolnika, številka popisa OIL 
  • št. biopsije (bioptični material).
• Vzorci iz parafina: 
  • številka biopsije
  • označeno tumorsko (T) ali netumorsko (N) tkivo.

Shranjevanje vzorcev takoj po odvzemu:

• Kri, plazma, punktat kostnega mozga, aspiracijska biopsija in eksudat: 
  • priporočljivo je, da vzorce še isti dan dostavite na Oddelek za molekularno diagnostiko
  • 1 dan (24h) jih lahko hranite v hladilniku na +4°C
  • če vzorce do transporta hranite več kot 24h jih je potrebno shraniti pri T = -80°C ali iz njih izolirati dedni material 
• Tkivo vklopljeno v parafin (FFPE): 
  • priporočljivo je, da vzorce še isti dan dostavite na Oddelek za molekularno diagnostiko
  • po narezu epico z rezinami tkiva takoj postavite v hladilnik (T = 4-10°C). 

Spremljevalna dokumentacija:

• Napotnica Oddelka za molekularno diagnostiko  
  • OBR-707-1070-MD-STO NAPOTNICA ZA MOLEKULARNO GENETSKO PREISKAVO - GENOTIPIZACIJA DEDNIH SPREMEMB.pdf,
  • OBR-849-1070-MD-STO NAPOTNICA ZA MOLEKULARNO GENETSKO PREISKAVO - GENOTIPIZACIJA SOMASTKIH MUTACIJ IZ TUMORSKEGA TKIVA.pdf
• V primeru, da je biopsijski materijal hranjen v drugih inštitucijah je potrebno napotnici priložiti tudi delovni nalog ali zeleno napotnico ali elektronsko napotnico.   
• Napotnici za testiranje iz tumorskega tkiva je lahko priloženo tudi histopatološko poročilo.
• Izpolnjen Zahtevek za pripravo vzorcev za molekularno biološko preiskavo iz biopsijskega materiala – izpolni patolog, ki pripravi material za testiranje. 
• Družinsko drevo za vzorce za preiskave dednih rakov.

Če bodo na napotnici ali vrnjenem zahtevku manjkali ključni podatki, bomo zahtevali dopolnitev spremljevalne dokumentacije. V kolikor dopolnitve ne bodo ustrezne bomo vzorec skladno s kriteriji za zavrnitev vzorca primorani zavrniti. V primeru, da iz podatkov na napotnici in oznak vzorec ne bo mogoče nedvoumno ustrezno identificirati, bomo vzorec skladno s kriteriji za zavrnitev vzorca prav tako primorani zavrniti.
 

Transport vzorcev: 

• Vzorci krvi, punktati kostnega mozga, aspiracijske biopsije in eksudati:
  • transport na sobni temperaturi, če je vzorec dostavljen v času krajšem od 30min.
  • transport na ledu, če je transport vzorca daljši od 30 minut (4-10°C). 
• Vzorci tkiva vklopljenega v parafin (FFPE): 
  • transport na sobni temperaturi, če je vzorec dostavljen v času krajšem od 30min.
  • transport na ledu, če je transport vzorca daljši od 30 minut.