Klinična orodja (baze) so namenjena kliničnemu in raziskovalnemu delu, bodisi celotnega Onkološkega inštituta bodisi posameznih oddelkov.

• UpToDate ANYWHERE
  vsi zaposleni na OI, dostop preko žičnega omrežja OI, možen tudi dostop od kjerkoli in kadarkoli (24/7)
• COCHRANE LIBRARY
  vsi zaposleni na OI, dostop preko žičnega omrežja OI
• CINAHL WITH FULLTEXT
  zdravstvena nega, dostop preko žičnega omrežja OI, 4 sočasne uporabe
• STATdx
  radiologija, radioterapija in nuklearna medicina, dostop preko žičnega omrežja OI in/ali dostop z uporabniškim imenom in geslom
• E-ANATOMY
  radiologija, radioterapija in nuklearna medicina, dostop z uporabniškim imenom in geslom
• Merative MICROMEDEX
  lekarna in interna medicina, dostop preko žičnega omrežja OI, 1 sočasna uporaba
• ALAMUT VISUAL
  molekularna diagnostika, dostop z uporabniškim imenom in geslom, 7 sočasnih uporab
• HUMAN GENE MUTATION DATABASE (HGMD) PROFESSIONAL
  molekularna diagnostika, dostop z uporabniškim imenom in geslom, 1 sočasna uporaba
• GENETISIST ASSISTANT NGS INTERPRETATIVE WORKBENCH
• molekularna diagnostika, dostop z uporabniškim imenom in geslom, 1 sočasna uporaba
• SEQENCE PILOT (SEQNEXT)
  molekularna diagnostika, dostop z uporabniškim imenom in geslom, 1 sočasna uporaba
• NAVIFY Mutation Profiler
  molekularna diagnostika
• MAGRESORCE MRI SAFETY DATABASE
  radiologija, dostop z uporabniškim imenom in geslom, 1 sočasna uporaba