Cirkulirajoči zunajcelični vezikli kot vir multi-omskih označevalcev nastanka bolezni povezanih z izpostavljenostjo azbestu in odgovora na zdravljenje pri malignem mezoteliomu
PODATKI O RAZISKOVALNEM PROJEKTU
ŠIFRA PROJEKTA: L1-60135
NASLOV PROJEKTA: Cirkulirajoči zunajcelični vezikli kot vir multi-omskih označevalcev nastanka bolezni povezanih z izpostavljenostjo azbestu in odgovora na zdravljenje pri malignem mezoteliomu
CENOVNI RAZRED: D
VODJA PROJEKTA: prof. dr. Vita Dolžan, dr. med.
VODJA PROJEKTA na OI: izr. prof. dr. Viljem Kovač, dr. med.
NOSILNA RAZISKOVALNA ORGANIZACIJA: Univerza v Ljubljani (Medicinska Fakulteta)
SODELUJOČE ORGANIZACIJE: Onkološki inštitut Ljubljana, Univerzitetni klinični center Ljubljana, Univerzitetna klinika za pljučne bolezni in alergijo Golnik
TRAJANJE: 1.1.2025 – 31.12.2027
FINANCIRANJE: Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
KRATEK POVZETEK:
Poklicna in okoljska izpostavljenost azbestu je povezana z razvojem azbestoze, plevralnih plakov, difuznih zadebelitev plevre, plevralnega izliva ter več vrst raka, med katerimi je eden najbolj agresivnih in smrtonosnih maligni mezoteliom (MM). Veliko breme bolezni in slaba napoved poteka bolezni MM zahtevata identifikacijo novih in zanesljivih diagnostičnih, napovednih in prediktivnih bioloških označevalcev za bolezni, povezane z izpostavljenostjo azbestu. Zunajcelični vezikli (ZV) omogočajo tako na omiki temelječe, kot tudi tarčne analize različnih skupin molekul iz celic, iz katerih izvirajo. Ker so te molekule v veziklih zaščitene pred razgradnjo, lahko zagotovijo obogaten vir bioloških označevalcev v primerjavi s prostimi plazemskimi biološkimi označevalci.
Cilj naše raziskave je identificirati in validirati neinvazivne biološke označevalce iz ZV za zgodnje odkrivanje MM pri posameznikih, ki so bili poklicno ali okoljsko izpostavljenostjo azbestu. Prav tako želimo identificirati neinvazivne biološke označevalce, ki napovedujejo napredovanje bolezni in odziv na zdravljenje pri bolnikih z MM.
V raziskovalne in validacijske raziskave bioloških označevalcev bomo vključili štiri klinično in epidemiološko dobro opredeljene kohorte. Kohorto 1 bomo izbrali izmed oseb, poklicno ali okoljsko izpostavljenih azbestu v Anhovem in okolici za eksploratorno analizo multi-omskih diagnostičnih označevalcev. Kohorto 2 bomo uporabili za validacijo in je sestavljena iz primerov z diagnosticiranim MM, azbestozo, plevralnimi plaki in podobno izpostavljenih kontrol brez azbestnih bolezni, ki smo jih obravnavali na Interdisciplinarni komisiji za priznavanje poklicnih azbestnih bolezni na Kliničnem inštitutu za medicino dela, prometa in športa UKC Ljubljana. V kohorto 3 bomo vključili bolnike z MM, ki jih zdravimo z imunoterapijo na Univerzitetni kliniki za pljučne bolezni in alergijo Golnik, kohorto 4 pa sestavljajo bolniki z MM, ki smo jih zdravili s kemoterapijo na osnovi platine na Onkološkem inštitutu Ljubljana. Iz vzorcev krvi, zbranih ob vključitvi in ob sledenju bomo izolirali ZV in jih okarakterizirali. Z multi-omskimi pristopi bomo opredelili v ZV obogatene in v plazmi prosto prisotne biološke označevalce, kot so miRNA in proteini, najbolj diferencialno izražene označevalce bomo nato potrdili s tarčnimi pristopi. Prav tako bomo identificirali in genotipizirali pogoste genetske spremembe v genih, ki jih uravnavajo različno izražene miRNA ali proteini. Zaradi velikega števila potencialnih bioloških označevalcev, identificiranih z multi-omskimi pristopi, bomo za analizo podatkov uporabili statistične metode, ki temeljijo na regresijski analizi in algoritmih strojnega učenja in sestavili kompleksne modele, ki bodo združevali klinične, epidemiološke in multi-omske biološke označevalce v algoritme odločanja.
Naš pristop bo tako lahko omogočil uporabo validiranih bioloških označevalcev za presejanje in zgodnejšo diagnozo MM pri azbestu izpostavljenih osebah in za personalizirano zdravljenje bolnikov z MM.