Dodatna opredelitev kliničnega pomena strukturnih različic in različic, ki vplivajo na strukturo RNA v genih povezanih z dednimi raki: Uvedba metode

Osebe, ki so obremenjene z osebno ali družinsko anamnezo dednih rakov imajo veliko verjetnost, da so nosilci patogene različice (PR) v genih povezanih z dednimi raki. V postopku genotipizacije eksonskih delov genov, običajno izvedeno z sekvenciranjem kratkih DNA odsekov, PR odkrijemo le pri manšem deležu preiskovancev (10-25 %). Določen delez PR ostaja neodkrit in predvsem gre za spremembe, ki lahko vplivajo na strukturo nastale RNA. Z uvedbo metod za zaznavanje sprememb, ki vplivajo na strukturo DNA in posledicno na strukturo RNA bi lahko natancneje opredelili nekatere različice z nejasnim kliničnim pomenom. Metoda bi v nadaljevanju omogocila tudi odkrivanje novih različic, pri močno obremenjenih bolnikih z neinformativno negativnim rezultatom genetskega testiranja. 

V raziskavo bomo vkljucili 50 bolnikov z osebno in/ali družinsko anamnezo dednih rakov. Vključili bomo: (1) preiskovance, ki imajo ze dokazano PR, ki povzroči spremenjeno strukturo RNA; (2) preiskovance, ki imajo dokazano različico nejasnega kliničnega pomena, ki na osnovi in silica orodjih predvidoma spremeni strukturo RNA; (3) preiskovance, ki so že imeli izvedeno gensko svetovanje in testiranje, vendar pri njih vzrok za klinično sliko se ni bil nedvoumno ugotovljen. 

Struktumo analizo RNA bomo izvedli s sekvenciranjem transkriptoma ali s sekvnciranjem dolgih fragmentov cDNA genov povezanih z dednimi raki. Pri nekaterih preiskovancih bomo izvedli tudi dodatno analizo DNA, s poudarkom na iskanju struktumih razlicic.  Namen raziskave je razjasniti pomen različic z nejasnim kliničnim pomenom ali odkrivanje se neodkritih PR, pri bolnikih z obremenilno anamnezo za dednih rakov. V ta namen nameravamo uvesti primemo metodo.