Pogostnost somatskega mozaicizma v genu APC pri pacientih z adenomatozno polipozo
Izhodišče: Adenomatozne polipoze so sistemski procesi, ki povzročijo nastanek večjega števila adenomatoznih polipov debelega crevesa in danke (DCD). Dedne adenomatozne polipoze so genetsko heterogena skupina, povezana z okvarami v več genih, za katere so znacčlni različni načini dedovanja. Predstavljajo vzrok za razvoj okoli I% rakov DCD. Somatski mozaicizem je stanje, pri katerem dedni zapis vseh celic v telesu posameznika ne vsebuje enakih genetskih različic. Nastane kot posledica genetske okvare/spremembe po prvi celicni delitvi zigote. Vzrok pomembnega deleža adenomatoznih polipoz predstavlja somatski mozaicizem za patogene razlicice/verjetno patogene različice (PR/VPR) v genu APC, ki lahko po podatkih iz literature predstavlja kar 20% adenomatoznih polipoz z negativno družinsko anamnezo. V klinični praksi je somatski mozaicizem verjetno podcenjen genetski vzrok adenomatoznih polipoz in rakov DCD. Primeri somatskega mozaicizma v genih, povezanih z dednimi oblikami raka, namreč pogosto ostanejo nezaznani, saj zaradi negativne družinske anamneze niso deležni genetske obravnave.
Pacienti in metode: V raziskavo bomo vključili 75 pacientov z 10 ali vec adenomatoznimi polipi debelega crevesa in danke ter negativnim izvidom genetskega testiranja za zarodne okvare v genih, povezanih z adenomatoznimi polipozami. Za vsakega pacienta bomo pridobili tkivo dveh adenomatoznih polipov, odstranjenih ob preteklih kolonoskopskih preiskavah in izvedli genotipizacijo tkiva polipov z metodo
sekvenciranja naslednje generacije na aparatu NextSeq 550.
Namen: Opredeliti delež pacientov, pri katerih je vzrok razvoja adenomatoznih polipov DCD somatski mozaicizem v genu APC; v raziskavo bomo vključili paciente z ugotovljenimi 10 ali več adenomatoznimi polipi debelega crevesa in danke ter negativnim izvidom genetskega testiranja za zarodne okvare v genih povezanih z adenomatoznimi polipozami.