Vrsta vzorca, odvzem in transport

Spremljevalna dokumentacija

Vzorci napoteni za molekularno-biološko preiskavo morajo biti ustrezno označeni in opremljeni z ustrezno dokumentacijo:

naročniki znotraj OIL –napotnica za molekularno-biološko preiskavo 

zunanji naročniki - napotnica za molekularno-biološko preiskavo, kateri je obvezno treba priložiti delovni nalog ali zeleno napotnico ali elektronsko napotnico.

Navodila za odvzem vzorcev krvi za molekularno genetske preiskave:

• OBR-1165-1070-MD-STO Navodila za odvzem vzorcev krvi za molekularno genetske preiskave

Navodila za pripravo vzorcev tkiva v EPICO za molekularno genetske preiskave:

• Tumorsko tkivo:
  • OBR-851-1070-MD-STO Navodila za pripravo vzorcev tkiva za izolacijo DNA/RNA v epico iz tumorskega tkiva
• Netumorsko tkivo:
  • OBR-854-1070-MD-STO Navodila za pripravo vzorcev tkiva za izolacijo DNA/RNA v epico iz netumorskega tkiva
• Izjemoma priprava na stekelcih:
  • OBR-853-1070-MD-STO Navodilo za pripravo vzorcev FFPE na stekelcih za genotipizacijo iz tumorskega tkiva

Za molekularno-genetsko določanje mikrosatelitske nestabilnosti (MSI) potrebujemo za vsakega bolnika 5-10 rezin tumorskega in ločeno še 5-10 rezin netumorskega tkiva. V primeru, da netumorsko tkivo ni na voljo, zagotovite vzorec krvi (odvzem v epruveto z EDTA).

Določanje MSI naročite z napotnico OBR-849-1070-MD-STO NAPOTNICA ZA MOLEKULARNO GENETSKO PREISKAVO - GENOTIPIZACIJA SOMASTKIH MUTACIJ IZ TUMORSKEGA TKIVA.

Navodilo za shranjevanje in pripravo citoloških vzorcev za izolacijo RNA:

• OBR-1018-1070-MD-STO Navodilo za shranjevanje in pripravo citolških vzorcev za izolacijo RNA

Sveže odvzeti vzorci (kri, kostni mozeg, aspiracijska biopsija in eksudat):

• ime in priimek bolnika, datum rojstva bolnika, številka popisa OIL
• št. biopsije (bioptični material).

Vzorci iz parafina: 

• številka biopsije
• označeno tumorsko (T) ali netumorsko (N) tkivo.

Kri, plazma, punktat kostnega mozga, aspiracijska biopsija in eksudat: 

• priporočljivo je, da vzorce še isti dan dostavite na Oddelek za molekularno diagnostiko
• 1 dan (24h) jih lahko hranite v hladilniku na +4°C
• če vzorce do transporta hranite več kot 24h jih je potrebno shraniti pri T = -80°C ali iz njih izolirati dedni material 

Tkivo vklopljeno v parafin (FFPE): 

• priporočljivo je, da vzorce še isti dan dostavite na Oddelek za molekularno diagnostiko
• po narezu epico z rezinami tkiva takoj postavite v hladilnik (T = 4-10°C). 

Napotnica Oddelka za molekularno diagnostiko:

• OBR-707-1070-MD-STO NAPOTNICA ZA MOLEKULARNO GENETSKO PREISKAVO - GENOTIPIZACIJA DEDNIH SPREMEMB
• OBR-849-1070-MD-STO NAPOTNICA ZA MOLEKULARNO GENETSKO PREISKAVO - GENOTIPIZACIJA SOMASTKIH MUTACIJ IZ TUMORSKEGA TKIVA

V primeru, da je biopsijski materijal hranjen v drugih inštitucijah je potrebno napotnici priložiti tudi delovni nalog ali zeleno napotnico ali elektronsko napotnico.   

Napotnici za testiranje iz tumorskega tkiva je lahko priloženo tudi histopatološko poročilo.

Izpolnjen Zahtevek za pripravo vzorcev za molekularno biološko preiskavo iz biopsijskega materiala – izpolni patolog, ki pripravi material za testiranje. 

Družinsko drevo za vzorce za preiskave dednih rakov.

Če bodo na napotnici ali vrnjenem zahtevku manjkali ključni podatki, bomo zahtevali dopolnitev spremljevalne dokumentacije. V kolikor dopolnitve ne bodo ustrezne bomo vzorec skladno s kriteriji za zavrnitev vzorca primorani zavrniti. V primeru, da iz podatkov na napotnici in oznak vzorec ne bo mogoče nedvoumno ustrezno identificirati, bomo vzorec skladno s kriteriji za zavrnitev vzorca prav tako primorani zavrniti.

Vzorci krvi, punktati kostnega mozga, aspiracijske biopsije in eksudati:

• transport na sobni temperaturi, če je vzorec dostavljen v času krajšem od 30min.
• transport na ledu, če je transport vzorca daljši od 30 minut (4-10°C). 

Vzorci tkiva vklopljenega v parafin (FFPE): 

• transport na sobni temperaturi, če je vzorec dostavljen v času krajšem od 30min.
• transport na ledu, če je transport vzorca daljši od 30 minut.