Bolnike z omejeno obliko bolezni zdravimo kirurško. Pri površinskih tumorjih pride v poštev izrez tumorjev, krioterapija ali laserska koagulacija, pri tumorjih kožice penisa obrezovanje, pri obsežnejših tumorjih delna ali popolna odstranitev penisa in ob povečanih dimeljskih bezgavkah tudi radikalna odstranitev dimeljskih bezgavk. Namesto kirurškega zdravljenja se lahko odločimo tudi za radikalno obsevanje penisa, ki več kot polovici bolnikov omogoča ohranitev penisa.
Pooperativno obsevanje penisa oziroma dimelj izboljša lokalni nadzor nad boleznijo. Kemoterapija je pri raku penisa slabo učinkovita.